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造血干细胞与骨髓移植在操作方法及经济成本上存在差异。亲属间的完全匹配移植通常所需的费用约为20万元人民币；而通过骨髓库寻找的完全匹配供者进行移植，则费用介于25万至30万元之间；对于半相合的骨髓移植情况，费用估计在30万元左右。值得注意的是，儿童进行此类手术的费用相对较低，具体费用主要由使用的药物种类决定。每种移植方案的费用考量因素多样，因此实际支出会有所波动。
自体干细胞移植的平均成本大约为15万元，这一数额可能因地域而有所浮动。鉴于其所应用的技术前沿性，相关手术的开销相对较高。值得注意的是，这种医疗程序通常不被包含在医疗保险的报销范畴内。该治疗过程涉及将个体自身的干细胞从体内引导至血液循环中，随后通过精密的净化步骤，再将这些纯净的干细胞回输到患者体内，以期达到治疗目的。
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